Giselher Schubert est professeur de musicologie à la Haute école de musique de Francfort-sur-le-Main. Il a été corédacteur en chef de la revue Musiktheorie de 1985 à 1995 et directeur du Hindemith-Institut (Francfort-sur-le-Main) de 1991 à 2011.
Giselher Schubert est responsable éditorial et éditeur scientifique des œuvres complètes de Hindemith et membre des comités éditoriaux des œuvres complètes de Weill, Webern, Eisler et Martinu.